月牙泉是一眼神奇的泉水，为什么说神奇呢，因为月牙泉始终是碧波荡漾，下雨天不会溢出，大旱天气不会干涸，处在沙漠中上千年，也没有被沙漠的流沙所掩埋，在戈壁中一点也不浑浊，当你在鸣沙山的一望无际的沙子中突然看见泉水时，你就更能体会他的神奇，月牙泉被人们称作天下沙漠第一泉。那为什么沙漠中的月牙泉不会干涸？
月牙泉是敦煌区域地下水在地面的自然露头，是整个地下水系统的一个组成部分，月牙泉接受着区域地下水的补给。然而，由于人类活动等原因，敦煌地下水位不断下降，月牙泉水位也随之下降。地处中国西北的敦煌曾长期依靠疏勒河、党河等河流的上游来水补给地下水，上世纪50年代以来，随着上游水库的修建，这些河流相继出现断流，敦煌地下水失去了补给来源。随着经济的发展，敦煌需水量在不断增加，目前全市每年要抽取4000多万立方米地下水，造成地下水超采严重。
在存水最少的1985年，月牙泉平均水深仅有0.7~0.8米；而且由于水浅，月牙泉一度分裂成两个小泉，从而失去了月牙形状。所以，2000年文字记载历史的月牙泉，在1985年已经着实“死”过一回了。
泉眼问题，月牙泉的泉眼确实是已经死了，但是有人说后来又打通了，也有人说通过地下水不断更新，那个红色年代，月牙泉的水也确实干涸了，并且阁楼被砸掉了，月牙泉的阁楼是后来修的，原来是一个寺庙，里面住着几个尼姑，月牙泉里也有鱼，水也能喝，确实非常神奇！水干涸以后政府开始补救，刚开始的时候不太会，直接往里面注水，水一旦变成死水就会变臭的，所以后来在月牙泉上方建了一个泉往里面渗水，算是月牙泉的母泉！
月牙泉东北有一个大缺口，形成进风口，这里常年刮着东风喝西北风，大风带着黄沙进入风口后，风流沿着周围的山坡做离心上旋运动，把流沙全部吹到了山顶，抛到山峰另一侧，所以沙漠始终没有掩埋月牙泉。泉底水流通畅。月牙泉是党河的一段古河道，而泉底又是松散的砂砾层，地下潜流不断补充保证了水体丰盛。
上世纪80年代由于当地过度垦荒灌溉，导致地下水位急降，月牙泉干涸见底可以行人，不见月牙形，成了两个小水池。如今看到的月牙泉是人工潜补给水，才又形成了月牙形。就是有名的天下第一泉济南趵突泉也有干涸停喷的時侯。原因无怪乎就是干旱少雨，河流断流，地下水过度开採利用。真正要恢复原来的自然水位是很难的，现在只有加大植被覆盖，栽树种草。改变小区域生态环境，不要过度开发旅游资源。以保这天下无双的奇特景观。
